Claude hjalp med at kortlægge mystisk celle-partikel i bakterier

Anthropics biologihold har fastlagt den første 3D-struktur af en såkaldt vault-partikel fra bakterier. Vaults er små, tøndeformede partikler i cellerne, som man tidligere har kendt fra pattedyr. Ifølge Anthropic har Claude haft en central rolle i arbejdet.

Arbejdet er indsendt som preprint til bioRxiv (pr. 4. november 2026). Det betyder, at det er offentliggjort, men ikke er dokumenteret gennemgået af andre forskere (peer review).

Søgning blandt 15 milliarder proteiner

Claude søgte i databaser med omkring 15 milliarder proteiner efter slægtninge til vault-proteiner. Søgningen fandt dem i 29 bakterielle rækker og fire rækker af arkæer, som er en anden gruppe encellede organismer. Proteinerne optrådte dog i under 1 % af arter med sekventeret genom.

Den bakterielle vault består af 96 kopier af proteinet, mod 78 i pattedyrs vaults. Den vejer omkring 9,5 megadalton, er 54 nm lang og 45 nm bred. Trods den kortere længde har den omkring 25 % større volumen end pattedyrs vaults.

Af 15 kandidatproteiner, der gav opløseligt protein, dannede 7 vault-lignende partikler under elektronmikroskop. Fire strukturer blev bekræftet med cryo-EM, en metode hvor man fryser prøver ned og afbilder dem i elektronmikroskop. Holdet lavede desuden 15 ændrede proteinversioner for at undersøge, hvordan partiklerne samles.

Claudes rolle

Claude hjalp med litteratur- og proteinsøgning, design af DNA-konstruktioner, optimering af isolering (blandt andet valg af kromatografisøjler), sporing af vault-proteiner og behandling af mikroskopidata. Claude styrede også selve strukturbestemmelsen i softwaren RELION.

Ifølge Anthropic tog rensningen af partiklerne cirka 90 minutter mod cirka tre dage med den konventionelle metode. Den første strukturmodel forelå efter cirka 34 timer mod typisk uger. Tallene er Anthropics egne og er ikke efterprøvet uafhængigt. Hele projektet varede cirka fire måneder, så de korte tider gælder enkelte trin.

Fejl undervejs

Claude begik også fejl. Den argumenterede først imod kromatografi, hvilket viste sig at være forkert. Den skrev en protokol med et uforeneligt vækstmedium, som gav cirka to ugers forsinkelse. I databehandlingen sprang den standardtrin over, så kortene over strukturen blev fejlbehæftede, og til tider improviserede den uhensigtsmæssigt. Ifølge Anthropic var fejlene dyrere på områder, hvor teamet selv var mindre fortrolige.

Hvad vaults egentlig bruges til, er stadig uklart. Leonard Rome, som var betalt konsulent og rådgiver for projektet, siger, at vaults funktion stadig er meget svær at klarlægge.